从水利水电工程转到港口与航道工程是交叉学科吗？

跨专业相当于专业课。你得从头学起。如果你有很强的学习能力，当然没有问题而且很难，除非你能把大学当成高中四年。

考研可以跨专业，专业课是跨专业考试的一大难点。多了解跨考专业的行业动态，拓宽自己的专业知识面，尽早准备专业课的复习，尽快熟悉跨考专业的学科思维。