北京大学药学院的研究生专业好还是中科院上海药理研究所的研究生专业好？

这个问题比较笼统。这两个地方都不错，但是不同专业不同导师有区别。中科院药学院的生物制药相关专业很强，基本代表了国内最高水平，但化学专业整体不如生物学强。北京大学药学院在医学相关专业方面还是比较强的。这取决于你。还有中科院不需要学费，每个月还有几千块的补贴。