商科专业考研转IT工程合适吗？

这没有什么合适不合适的。跨专业很常见，但现在越来越多的学校更看重本科专业和成绩。如果你想申请一个相对好的学校，相应的要求肯定会更高。初试成绩足够高，专业知识足够扎实，复试没有大的失误就够了。